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Covid-19在开源地图中的案例。照片:Rob Goodier。屏幕上的图像:chschoenenberger.shinyapps.io/covid19_dashboard

ICT.

7月26日2021年

我们创建了一个帮助预测Covid-19在非洲国家的增加

贡献者:对话

如果您试图指导政策并保护来自Covid-19的人的障碍是每天可用的令人困惑的数据。我们被唤醒了解,但每个人都希望展开洞察力。

政策制定者需要了解数据,以预测和管理发生的事情。为了解决这种需求,我们开发了一种数据驱动的疾病监测框架,以跟踪和预测国家级Covid-19案件。

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我们是一名关于新颖的方式研究的科学家团队预测诊断患有严重感染时。我们从基于模型的传染病预测开始。最终我们有兴趣在传染性药剂未知时改善治疗。但对于Covid-19,我们的方法对理解和预测人口层面的感染是有价值的。

我们的重点是东非和东南亚的婴儿感染。超过15年,我们已经工作与乌干达医院,医疗保健提供商,规划师,经济学家,工程师和政策制定者关于婴儿感染和出生缺陷的预测映射。

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2020年初我们开始讨论使用我们技能促进对抗小说SARS-COV-2的斗争的方法,导致Covid-19的病毒。我们分为广泛的专家,组织和地方当局网络。他们帮助我们适应我们的方法,以产生一周的Covid-19案件编号。

我们创建了一套可视化工具和图形非常容易解释。我们与乌干达策划者和经济学家密切合作,确保我们共同创造的。我们建立在英国和几个欧洲国家已经使用的经过验证的方法,将其适应整个非洲大陆。

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本研究中使用的模型集成了多组数据来预测CoVID-19传输。层,从上到下:Covid-19案例计数,特定湿度,降雨,人口和温度。照片:Andrew Geronimo

模型是如何构建的

我们使用了一个相对简单的模型,通过数学标准来基于计算机代码。我们纳入了每个国家的每日案例报告,以及每个国家,人口,人口,社会措施的严格性,控制感染的人类发展指数以及气象数据的表征。我们考虑到邻国的案件,以及该国是内陆的。

我们的模型使用案例编号报告给上周和包括前一周,以预测未来一周内的案例编号。

该模型包括过去的温度,降雨和特定湿度的天气观察。其中一些环境因素涉及非洲外部的Covid-19传输。我们通过调整人口来修改每个国家的天气数据。例如,在阿尔及利亚,在大部分人口沿着较冷的,湿润的海岸生活,我们强调或重量天气数据与人们生活(并忽视未填充的沙漠)的地方。

我们考虑到商品和商业的跨境流动,因为对于内陆非洲国家,这是他们的商品和服务的生命线。

对于非洲来说,难以获得人口流动性数据,因此我们在所有其他国家/地区使用案件来测试这些案件是否与附近国家的下周案件有关。这证明非常有效。

我们在不同国家的经济学中考虑,以及锁定和边境封闭等实时政府严格政策的演变。

然后我们需要看看我们是否可以获得非洲大流行状态的理解摘要,以及是否与实际测量案件编号相比一周左右的预测是准确的。

从预测到政策

预测比我们预期的更准确。我们聘请了对每个国家的严格评分预测方式。只有几个国家的这些预测是不准确的(布隆迪,喀麦隆,索马里和博茨瓦纳)。为了可视化这些预测,我们创建了一组非常容易解释的工具和图形。一个政策人员需要看看现在的情况是什么,目前国家如何从过去的事件中到达那里,以及将来会发生什么。这网站我们创建的将使任何人都可以使用计算机鼠标选择他们的国家/地区或大陆,并查看模型的结果。无需数学或博士。

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对于其他国家或全球机构的技术科学家,我们正在分享我们的完整代码。我们在免费的开源软件中撰写了这段代码,以及模型使用的所有数据来自自由开源网站,以便任何人都没有实现障碍。我们的方法压力数据是预测性的,并自动忽略下周没有促进对案例的数据。这是经济学中的一个古老的伎俩,我们发现它在预测传染病时非常适用。

出版物包含运行模型的计算机代码的链接,以及用于任何使用的这些发现的图形显示。

我们在乌干达的同事是找到此模型很有用在预测未来一周的情况下。他们正在使用它来帮助提供社会政策和锁定,因为它们跟踪对案件的影响,并计划重新开放等内容的压力。由于控制措施的效果延迟了一段时间,因此预测能够更好的政策规划。但是,如此多的事情,如天气,超过两周的预测往往非常不确定。

展望未来

我们调查结果的明确含义之一是,Pandemics是危机,即没有国家可以最佳地管理。我们鼓励邻近的非洲国家分享数据并合作旅行和边境管理。

这种大流行将通过非洲的大规模疫苗结束。直到数十亿份额外的安全和有效的SARS-COV-2疫苗适用于非洲,将需要预测方法,以帮助通知政策。对话


关于作者

史蒂文J. Schiff是在宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州宾夕法尼亚州立大学的工程科学和工程学,工程科学和机械部门和物理学中工程师傅。

Andrew Geronimo是宾夕法尼亚州立大学神经外科部门的助理研究教授。

Claudio Fronterre是兰开斯特(英国兰开斯特大学卫生信息学,计算和统计中心的生物统计学讲师。

Paddy Ssentongo是宾夕法尼亚州立大学工程科学与力学系的神经工程中心助理研究教授。


本文已重新发布对话在创造性的公共许可下。阅读来源文章

标签:非洲新冠肺炎对话

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